มหาวิทยาลัยกรุงเทพจัดการศึกษาระดับอุดมศึกษาทั้งหลักสูตรระดับปริญญาตรี ระดับปริญญาโท และระดับปริญญาเอก โดยแบ่งเป็นคณะ/สาขาวิชา ครอบคลุม 2 กลุ่มสาขาวิชา ได้แก่ กลุ่มสาขาวิชามนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์ และกลุ่มสาขาวิชาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มีหลักสูตรและการจัดการเรียนการสอนในคณะวิชาต่างๆ ดัง

• ระดับปริญญาตรี จำนวน 44 สาขาวิชา ประกอบด้วย หลักสูตรภาษาไทย 37 สาขาวิชา และ หลักสูตรนานาชาติ 7 สาขาวิชา
• ระดับปริญญาโท จำนวน 14 สาขาวิชา ประกอบด้วย หลักสูตรภาษาไทย 10 สาขาวิชา หลักสูตรภาษาอังกฤษ 1 สาขาวิชา และ หลักสูตรนานาชาติ 3 สาขาวิชา
• ระดับปริญญาเอก จัดการศึกษาเฉพาะหลักสูตรนานาชาติ จำนวน 3 สาขาวิชา

ปีการศึกษา 2558 มหาวิทยาลัยมีหลักสูตรที่จัดการเรียนการสอนทั้งหมด 61 หลักสูตร ทุกหลักสูตรได้ดำเนินการตามกรอบมาตรฐานคุณวุฒิระดับอุดมศึกษาแห่งชาติ พ.ศ. 2552 (TQF: HEd) โดยผ่านความเห็นชอบจากสภามหาวิทยาลัยกรุงเทพครบทุกหลักสูตร รวมทั้งสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา (สกอ.) ได้ให้การรับทราบการให้ความเห็นชอบครบทุกหลักสูตรแล้ว

นอกจากนี้มหาวิทยาลัยได้ดำเนินการเปิดหลักสูตรใหม่ในปีการศึกษา 2559 ที่เป็นไปตามกรอบ TQF: HEd จำนวน 5 หลักสูตร ซึ่งสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา (สกอ.) ได้ให้การรับทราบการให้ความเห็นชอบหลักสูตรแล้ว